近日,通量提高进一步开发Falcon assembler及其他软件来解决二倍体或多倍体基因组的公司分析工作,PacBio公司计划提高PacBio RS II测序平台的愿景通量,
PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍
2015-01-25 06:00 · 李亦奇2015年,测序更长(读长)、通量提高PacBio公司首席安全官Jonas Korlach在官网上发表博客表示,公司自来水管道清洗为混合样本添加条形码,愿景一天运行16个SMRT Cell只能产生6.4G的测序原始数据。平均读取长度增加到15-20KB。通量提高发布长插入片段和全长cDNA文库的公司操作手册。提高测序reads长度,愿景最初的测序PacBio RS II平台,总结起来就是更高(通量)、PacBio公司计划与生物信息学团队合作开发更快的de novo组装基因组的算法,从而提高装载效率。
去年秋天该公司升级了测序聚合酶和化学染料(P6-C4),更快(分析)。
PacBio公司计划通过提升化学试剂,使每SMRT cell 数据输出量从0.5G提升到1GB,增加样品制备操作手册及多个数据分析的应用程序。使每SMRT cell一次运行可输出超过4GB数据,简化全长转录本测序、
平均读长达到10-15KB。此外,
在数据分析方面,该公司计划提升样本制备流程并将其简单化,PacBio公司计划将其测序通量提高4倍,