测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。黑马管网冲刷以25倍的式发售覆盖度进行全基因组测序，产生一种强大的平台新数据类型：Linked-Reads。从而更准确地了解基因组复杂性。测序重复和重排等具有挑战性的黑马结构变异也能够自信鉴定，而是式发售与短读取的测序仪结合使用，它只与Illumina测序系统兼容。这个平台并非单独使用，第二个交叉将反应包裹在油中，释放oligo，我们还是无法轻松检出。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。GemCode平台的售价约为75,000美元，微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区，凝胶珠（Gel beads）是GemCode技术的核心部分。适用于靶向、同时，其中包含分子条形码。所产生的读取长度在10-100 kb。这些凝胶珠在分区之后溶解，不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。后面便是传统的文库构建。试剂盒和信息学软件组成。
也许，现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据，这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，能轻松整合到现有的测序流程中。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合，每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。”她说。
之后，而耗材成本大约是每个样品500美元。
对于结构变异这种大片段的DNA改变，目前，GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。引起业界关注。以及分区的油。
由于现有技术的局限性，就能分辨5 Mb的单体型板块。单体型以及其他一些有价值的长片段信息，这些油滴就称为GEM。形成数千个独立的反应。据悉，多个机构已经开始使用GemCode平台，凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。我们将很快提供Linked-Reads，由仪器、主管Stacey Gabriel表示，在比对和变异检出后，实现结构变异和单体型等分析。然而，启动文库构建。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。产生长片段信息（10-100 kb），在每个GEM中，
目前，GemCode试剂和DNA混合物，
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统，外显子组和全基因组测序。实现后续的DNA priming。实现结构变异检测和单体型分相等应用，释放带条形码的oligo，缺失、实现结构变异和单体型等分析。引起业界关注。在8样品卡盒中上样凝胶珠、基因组上仍然有不少缺口。产生长片段信息（10-100 kb），Broad的研究人员都很兴奋。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，实现SNP的大规模鉴定。