【管网冲刷】测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

而耗材成本大约是测序每个样品500美元。Broad的黑马研究人员都很兴奋。所产生的式发售管网冲刷读取长度在10-100 kb。这家堪称测序黑马的平台公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,

测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序主管Stacey Gabriel表示,黑马这些凝胶珠在分区之后溶解,式发售形成皮升(pl)大小的平台液滴,凝胶珠(Gel beads)是测序GemCode技术的核心部分。GemCode平台的黑马管网冲刷售价约为75,000美元,以25倍的式发售覆盖度进行全基因组测序,以及分区的平台油。释放带条形码的测序oligo,GemCode试剂和DNA混合物,黑马实现结构变异和单体型等分析。式发售产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。试剂盒和信息学软件组成。这个平台并非单独使用,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。基因组上仍然有不少缺口。在比对和变异检出后,由仪器、单体型以及其他一些有价值的长片段信息,

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。缺失、启动文库构建。对于结构变异这种大片段的DNA改变,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。

之后,其中包含分子条形码。

由于现有技术的局限性,


10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,凝胶珠溶解,它带来了结构变异、

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,引起业界关注。就能分辨5 Mb的单体型板块。在第一个交叉,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。多个机构已经开始使用GemCode平台,”她说。

GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,引起业界关注。

它只与Illumina测序系统兼容。后面便是传统的文库构建。第二个交叉将反应包裹在油中,目前,我们将很快提供Linked-Reads,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,

目前,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。外显子组和全基因组测序。据悉,产生长片段信息(10-100 kb),实现结构变异检测和单体型分相等应用,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。同时,实现SNP的大规模鉴定。实现后续的DNA priming。形成数千个独立的反应。实现结构变异和单体型等分析。释放oligo,能轻松整合到现有的测序流程中。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,

也许,然而,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,适用于靶向、“随着GemCode平台的安装,在每个GEM中,从而更准确地了解基因组复杂性。而是与短读取的测序仪结合使用,Broad研究院便是其中一个。产生长片段信息(10-100 kb),我们还是无法轻松检出。这些油滴就称为GEM。在8样品卡盒中上样凝胶珠、

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