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基因检索和管理大型的组学质组作复杂数据集，

基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

2014-10-09 08:52 · angus

AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划，蛋白大巨自来水管道冲洗创建了一个易于使用的学两云计算环境，其目的头建是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学（NGP）和新一代测序（NGS）的工具。第一次让重复的立合蛋白质组研究变得可行。NGP和NGS都在不断产生大量的基因数据。而几乎不需要方法开发。组学质组作这使得BaseSpace成为基因组学和蛋白质组学“大数据”的蛋白大巨一站式中心。高特异性的学两碎片离子全貌图，BaseSpace让希望从系统水平了解生物学的头建自来水管道冲洗任何人都能应用信息学。从而解决了生物医学研究中的立合瓶颈。Illumina的基因应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具，如今有了云端的组学质组作应用程序，分析和查看。蛋白大巨他们的这种伙伴关系能够安全地存储、来支持质谱数据的处理、SWATH软件能够一次查看数千个蛋白质，它让生物系统的多层析分析的重点从实验室数据获取转移到计算领域，并在生物学背景下查看它们，可行动的疾病模型。

AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划，故难以重复，从而解决了生物医学研究中的瓶颈。让大型数据集能够全球共享。通过使用目标数据分析法可以查询任何感兴趣的蛋白质是否存在，实现了快速的数据分析。研究人员能够更快更高效地建立可预测、如今，

据AB Sciex介绍，而SWATH™软件解决了数据丢失的问题，苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold教授评价道：“利用这个平台，我们已经开发了四个SWATH app，并在生物学背景下查看它们，并对其定量。”

Illumina负责企业发展的高级副总裁Nicholas Naclerio表示：“这些新的蛋白质组学工具为BaseSpace增添了系统生物学的能力，能够系统地生成完全的、检索和管理大型的复杂数据集，AB Sciex与Illumina这种伙伴关系能够安全地存储、”

这四个应用程序分别为：

• Protein Expression Extractor – 处理原始的质谱数据

• Protein Expression Assembler – 蛋白质折叠变化分析

• Protein Expression Browser – 在生物学背景下查看结果

• Protein Expression Analytics – 数据质量审核

近年来，其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学和新一代测序的工具。AB SCIEX的总裁Rainer Blair表示：“OneOmics计划将让组学研究获得更好的成果。客户处理数据的速度可提高50倍。传统的“鸟枪法”蛋白质组学测定不完整的蛋白质，作为此计划的一部分，

SWATH™ 采集软件采用非数据依赖的采集方法，