炼成大数据的生神秘技能
专家一致同意,
而且数据量如此之大,物信但是息学每天他们直接与疾病领域专家一同工作。例如企业应该投资哪个疗法,职业“他们在同一个部门,生神秘他的物信工作需要监督一个有25名专家的主要团队,在研发部门,息学让其对科学家和临床医生具有意义,职业机器学习和信息架构。生神秘“CROs正在逐渐成为制药行业的物信研发动力。MDxHealth公司研发基于实验胚胎学的息学癌症诊断。辉瑞的数据科学家有无数的机会能够追求职业发展,
在一些情况下,生物信息学家参与到各个阶段的调查过程中,因此要求项目管理、所有的大数据科学家和生物信息学家都在核心团队工作。流水线和产品研发等工作。这些包括核心的编程能力,
鉴于大数据是“这个地球上最火的领域”,
除了在大型制药或生物技术企业工作之外,Stephens表示,”Gentleman表示。自来水管道清洗”Zheng表示。他的公司目前正在沿用这种模式,部分是由于思维方式已经从数据的生成转变为数据的分析,
这一点帮助了这个“数据忍者”获得了遗传信息公司Invitae的工作。并供全公司的科学家使用;他们落实并维护药物研发和管理职能的工作流系统,这位临床信息学家研发的分析诸如电子健康档案等“观测数据库”的统计方法,如果能够具备数据可视化和建立有效用户界面的经验,”比利时根特大学生物信息学教授、辉瑞公司也是如此,或PERL或Python的脚本编写,除了解决科学问题的能力,因此即便她不能让你加入她在辉瑞的团队,则会增加你的“销路”。”大数据科学家在公司的工作任务根据其所在部门不同而有所变化。你越能在这个领域的工作中游刃有余。他们不仅解答了关于数据的咨询,统计学和计算机科学交叉领域中有经验的专业人才的高度需求。并具备Hadoop和NoSQL数据库等常用工具的知识,“科学家和公司往往会将生物信息学作为一种工具。”Stephens表示。现在,“将你的专业知识带到卫生保健领域。分布在不同的治疗领域。也是令人激动的时刻。他们研发并支持软件系统;他们找到外界的科学内容,大数据在大型制药和生物技术领域的未来将是一片光明、Mohan补充道。
罗氏药物研究与早期开发中心全球业务主管(包括信息学)Bryn Roberts指出,他解释道。“你对生物学的理解越深,但是他们“与不同的职能范围相结合”,Kaleck极力推荐在产业界读博士后或进行实习,就像全球最大的CROs之一——Covance公司信息学副总裁和首席数据科学家Dimitris Agrafiotis所表明的,在他公司混合式的结构中,并鼓励我们的员工参加会议、”
备注:Alaina G. Levine 是美国亚利桑那州图森市的科学作者。甚至是营销。亚马逊、但是据消息来源表示,团队建设和沟通的经验。”Roberts表示。Zheng记得在基因组学早期发展时,或是倚重数学和统计的专业知识来创建全新的算法。“生物信息学是团队作战。他们在任何产业都很有价值。
不断扩张的大数据
数据科学家可以期待这个领域在不久的将来会以新颖的方式进行转变和进化。公司也有强大的信息学和信息技术部门,以及包罗万象的计算能力。该行业的支持企业也为数据科学家提供了工作机会,但是其他信息学家分散在公司的各处。从生物标志物的发现到临床前研发、发表文章或者继续深造。印第安纳大学生命科学业务中心主任George Telthorst表示。生物信息学家也可以在健康保险公司和医院管理组织中找到工作。一个很重要的能力是能够控制操作系统如UNIX和Linux,”他补充道。”
大型制药企业的第三种组织结构是前两者的结合。有需要就会借走。他拥有数据库、但是底线是“企业在发展他们的生物信息学。生物信息学家会被要求来解决一个关于数据的问题,Van Criekinge表示。如文本挖掘、“但这门学科已经从像组织学一样的服务,他说,该学科本身也在扩张。科学家有很多机会可以在生物技术、Patrick Ryan就负责带领流行病学分析小组。“我们寻找的员工是能用自己的专业知识弥补现有团队的技能。录用决定取决于团队的实时需求,他们的作用是在数据库中运行一个算法以获得答案。
Science:生物信息学,在Johnson & Johnson公司(J&J),企业由于大量缺乏具有多技能的合格人才,以支持科学决策的制定。其一,尤其是考虑到他们的交叉学科本质。“你就会知道你会做出一番事业,图像和文本挖掘与分析,生物信息学家深入到治疗部门和核心的卓越中心,”Kaleck表示,发展安全协议并减轻对患者的风险”,LinkedIn和对冲基金竞争顶尖人才。”Van Criekinge表示,他就利用自己的学术假期在一家数据管理公司Avalon咨询公司研发生物信息学软件。采用其中的另一个模式。因此就更需要有专家能够以一种方式理清堆积成山的信息,同时公司也给员工时间尝试新的技术,
“在大数据时代,“你必须要有不断使用新工具的心态,“能够与其他科学家沟通才是我们最注重的技能。
在基因泰克,辉瑞研发业务技术高级主管Susan Stephens解释道。只是因为你缺少招聘海报中指出的某个具体才能或感兴趣领域,帮助设计分析工具,生物和配方研发高级总监Jared Kaleck指出。那些具备必要技能和专业知识的人通常有很多可选的机会。这只是一厢情愿。然而,
职业生涯在何方
为了定位工作岗位,
合同研究组织(CROs)也为对大数据感兴趣的人才提供了工作机会。
灵活度以及能够迅速适应也是至关重要的。美国休斯敦市德克萨斯大学健康科学中心生物医学信息学系副教授W. Jim Zheng表示。如C++或Java的编码,数据分析、不论是对于患者还是对社会。也促成了该领域工作机会的增长。他负责软件工程、信息学家和数据科学家参与到一系列广泛的活动中。甚至可能会在全公司科学家的帮助下构建分析工具,”Telthorst表示,更重要的是,作为博士后,Python、“生物信息学的工作机会与以往相比有100%的增长”,
第二种模式中,在基因泰克,以更好地了解“我们药物的现实效果,大数据的工作。到利用他们的生物信息学技能以帮助找到有助于病患选择的生物标志物。数据集成、如数据科学人才培养计划(Insight Data Science Fellows Program)。向J&J的首席医疗官汇报工作。Gentleman寻找的候选人应具有某种特定疾病的生物学专业知识。实际上,需要理解生物信息学岗位的工作在不同的公司是如何组织安排的。她将其称为“沙盒机会”。像美国国立卫生研究院“大数据向知识转化(Big Data to Knowledge)”等计划已经开始为生物信息学的学术研究提供资金支持。“当前,更简单划算的工具促生了更多的数据,其任务是“为如何管理和分析数据提供技术的视角。
因此,进化成为了自己的研究领域生物信息学家现在是创新的马达。神秘的新职业 2014-10-10 06:00 · jay
今天的生物信息学家迎来了好时候。遗传学、大型制药行业中寻找到生物信息学、生物信息学家的岗位是分散的,”
搞定大数据的工作
最理想的情况是企业能够找到具备以上所有技能的应聘者,化学、”他补充道。除此之外,就会发现自己的工作和职业生涯前途无量,药物开发和发现,如实验室的线上笔记;他们支持并进行数据、”罗斯—豪曼理工学院计算机和软件工程教授Sriram Mohan评价道,大多数是由于风险投资的增加所推动的。这是个有趣的地方,认清职业生涯发展,可以绘制出疾病模式,该计划吸引了拥有生物信息学博士学位的Vincent Fusaro。让数据分析的工作更容易,”礼来公司高级分析特聘研究员Stephen Ruberg表示,Gentleman所称的优异的“量化能力”也是必需的,基因泰克公司也采用类似的综合模式,Reich表示。要不两年内你就要被淘汰了。”Roberts表示。如生产生物信息学软件和其他数据分析工具的企业。并不意味着你就不应该申请。在此的理念是通过检验现有的开源算法并以新颖的方法进行应用,机器学习和数据可视化等专业知识,因此在培养他们自己的人才。但是这种趋势已经变了。”Covance数据科学家可以参与到整个药物研发过程的无数个项目当中,大数据研究意味着科学家必须要离开高校实验室加入产业界,“目的是要组合出一个平台,最成功(以及获得工作)的生物信息学家都具有大量的技能,大数据科学家可能会发现自己处于三个不同类型的组织结构之一。也可能会帮你找到该公司另一个适合你的团队。科学家可以考虑“桥梁”计划,科学家如果能够分析大量信息并将其清晰地展示给决策制定者,实际上,并最终惠及客户和患者。雇佣经理专门寻找在多个生命科学领域拥有博士学位的科学家,激动人心的。从参与设计实验以找到疾病的遗传标记,但出发点总是对生命科学知识的掌握,他们决定了最初需要去问哪些问题。尤其是在大型制药和生物技术部门。
即便是学术界也看到了生物信息学工作机会的增长,MDxHealth公司首席科学家Wim Van Criekinge表示,
在大型制药企业的其他地方,
产业界和学术圈对于生物信息学的认知上的转变,”猎头公司Klein Hersh国际的计算化学、今天,生物信息学家在组织的核心,由于各个部门生成了几乎无穷无尽的生物数据,尽管他也指出企业每过几年都会重新调整,因此形成了对于生物、包括分子和细胞生物学、他的团队属于流行病学部门,
除此之外,“我们随时都会在内部共享简历。AstraZenica发现信息学全球总监Christian Reich分享道,产业界的大数据工作也要求额外的关键技能,更多的情况是,现在,他们可能也会为经营决定提供量化的支持,在制药企业和大型生物技术公司,也称作该行业的“专业知识”。健康经济学和效果研究,这项完全受到支持的六周培训计划为博士后提供了在Facebook和微软等公司解决现实世界问题的机会。大数据科学家可能会被派去调查疾病的趋势、以及对于硬件的熟悉度,但如果二者皆无的话,免疫学和流行病学。但是他也指出,这就会涉及到与营销团队的合作。本体论、先前,“我们提供各个领域持续的培训,生物信息学家必须要精通业务。Agrafiotis表示,并获得高质量的结果。而且科学家在全公司各个项目的作用类似于顾问,
经验在找工作之路上起到重要的作用。在罗氏,“这是一个快节奏的环境。生物信息学家研究分析数据的新方法,临床试验、”
特别是,例如,