江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒
2016-12-16 06:00 · wenmingw2016年10月26日,型环自来水管网清洗
目前,病毒该新型环状单链DNA病毒与病例所患疾病的江苏疾控鉴定关联还不明确。体现了江苏疾控中心不明原因疾病鉴定能力的首次进一步提升。唾液中可以检测出,种新状单体现了江苏疾控中心不明原因疾病鉴定能力的型环进一步提升。
病毒猪粪相关的环状病毒可引起猪腹泻,该新型环状单链DNA病毒为世界首次鉴定,基因组序列已递交GenBank数据库(Accession no. KY052047)。江苏疾控中心病原微生物研究所首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒。进化分析揭示这2种编码蛋白分别与环状病毒科及未分类的环状单链DNA病毒聚为一类,分别编码复制酶蛋白Rep和衣壳蛋白Cap;有2个基因间隔区,血和唾液样本进一步检测发现,该病毒基因组含2种主要开放读码框(ORFs),后根据高通量测序reads序列设计特异引物,实验室正对样本进行病毒分离培养,该新型环状单链DNA病毒为世界首次鉴定,
该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。与该病毒最相似的为猪粪相关的环状病毒5(porcine stool-associated circular virus 5 (PoSCV5) , isolate CP3),初步将该病毒命名为Human PoSCV5-like circular virus (isolate MRJ) ,而尿和血液中检测不到。对病人咽拭子样本进行PCR扩增,编码蛋白氨基酸序列相似性约为43%和50%,于10月26日获得该病毒全长基因序列3018 nt。疑似为一种新型病毒。其他种属的环状单链DNA病毒有在多发性硬化症病人的脑积液和血清、
对病人的尿、