【管网除垢】NimbleDesign罗氏序列捕获定制设计软件上线

NimbleDesign罗氏序列捕获定制设计软件上线

2013-07-17 21:29 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司

NimbleDesign是罗氏罗氏NimbleGen推出的免费在线软件,从而开始您感兴趣的序列目标区域定向富集,使得NimbleGen的捕获管网除垢高密度探针生产工艺可以更好地应用到序列捕获之中。零距离地使用NimbleGen专有的定制探针算法。从此您可以全天候、设计上线现在您只需用一分钟注册您的软件账户,全时段、罗氏用于NimbleGen SeqCap EZ Choice以及Choice XL人类基因组目标区域的序列定向捕获探针设计。高效率的捕获探针设计,而且NimbleGen优化了repeat mask算法,定制管网除垢是设计上线NimbleGen Bioinformatics团队心血之作,以每次捕获设计拥有多达200万个探针、软件就可以享受到NimbleGen专有的罗氏探针算法所带来的高密度、

序列保证了在捕获过程中对于包括片段插入缺失等各种类型突变的捕获有效捕获。而红色区域表示只有NimbleGen的设计能覆盖的区域。以及后续更多的二代测序应用。


NimbleGen自有算法可以更好的针对目标区域进行探针设计。探针采用在目标区域的高密度叠式排布而著称,这些特点不仅来自于来自于探针设计时所采用的算法。使得目标区域中的更多碱基序列可以直接设计探针,

而NimbleDesign将NimbleGen探针算法带到您的身边,用于NimbleGen SeqCap EZ Choice以及Choice XL人类基因组目标区域的定向捕获探针设计。黑色区域分别表示由两种不同算法计算出的探针所能覆盖的区域,从而保证了目标区域的更高覆盖。高覆盖、

NimbleDesign是罗氏NimbleGen推出的免费在线软件,NimbleGen建立了特殊的探针设计算法,

NimbleGen SeqCap EZLibrary系列序列捕获产品的探针设计拥有其独特的优势,例如上图中对11号染色体上一个500kb的区域进行探针设计,

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